Началась «Новая Вифания» с домашней группы верующих, которая собиралась с осени 1995 года в доме Виктора Ивановича Никоненко. Многие члены ячейки в то время учились в Библейском институте, открытом канадскими миссионерами, которые также оказывали нам спонсорскую и духовную поддержку.

11 мая 1996г. пасторы-миссионеры: Рон Колеба, Джим Скоуби, Арвид Олсон совершили таинство рукоположения В. Никоненко - на пастора, В. Ермакова на - евангелиста и В. Рокочего - на диакона.

Уже 19 мая было совершено первое крещение – к церкви присоединилось 27 человек.

Благодаря дружеским связям пастора Никоненко В.И. с Краснодарской церковью «Вифания» завязались братские отношения между двумя общинами.

Это было время бурных дебатов по поводу различных аспектов внутрицерковной жизни. Мы учились любить и терпеливо принимать друг друга. Нелегко было ломать старые привычки и традиции, всё проверялось «на зуб», и мы постепенно убеждались, что Бог даёт нам гораздо лучшее, чем то, что мы знали и чем пользовались в прошлом.

14 февраля 1997г. «Новая Вифания» получила свидетельство о регистрации. С тех пор этот день отмечается как День рождения церкви.

Церковь начала бурно расти. И вскоре община благословила служителя Юрия Гриненко на открытие цекви «Ковчег» в пгт. Солёное.

Примерно с 1999г. для «Новой Вифании» начинается непростое время испытаний. Из-за кадровых перестановок, община теряет большую группу активной молодёжи. Еще одним ударом для церкви стала потеря здания, приобретенного для нужд общины. Но церковь достойно прошла этот непростой период.

В феврале 2004г. пастор Никоненко В. уезжает на миссионерское служение в Луганскую обл., рукоположив Ермакова В. на пасторское служение.

На то время в церкви назрела очевидная необходимость включения её в какую-либо существующую в Украине конфессию, и община приняла решение встать под духовное покровительство церкви «Посольство Божье». Поднимается сильная, зрелая команда новых служителей и лидеров, проводится регулярные конференции, рождаются новые востребованные служения. Каждое лето проводятся выездные семинары с участием пастора Хвалова В.

В 2008г. пастор Никоненко В.И. , вернувшись из Луганской обл., начинает готовить проект открытия очередной церкви и целая команда служителей «Новой Вифании» включается в это долгожданное дело.

В августе 2010г. на общем собрании церкви было принято решение о выходе из членства и покровительства церкви "Посольство Божье" в связи с духовными проблемами этого движения.

Особенностями нашей общины на протяжении всего времени её истории являются:

- отсутствие многоразовых и обязательных пожертвований;

- высокий уровень личностной, духовной и творческой свободы;

- присутствие семейной атмосферы на всех собраниях;

- готовность иметь братские отношения с церквями независимо от их деноминационной принадлежности.